Στο μέσο του συγκροτήματος των κελιών και των κοινόχρηστων χώρων της Μονής δεσπόζει το παρεκκλήσιο των Αγίων Αναργύρων Κοσμά και Δαμιανού, των εξ Ασίας — δύο αγίων που ανέκαθεν τιμώνται ιδιαιτέρως από τους πιστούς για τη χαρισματική ιατρική διακονία τους, την οποία προσέφεραν δωρεάν και ανιδιοτελώς στους ασθενείς και πάσχοντες. Το παρεκκλήσιο ακολουθεί τον βυζαντινό ρυθμό, εναρμονιζόμενο με την πνευματική και αισθητική παράδοση της Ορθόδοξης μοναστικής αρχιτεκτονικής, και ανεγέρθηκε το έτος 1981, εμπλουτίζοντας το μοναστικό συγκρότημα με έναν ακόμη χώρο λατρείας και προσευχής. Τα εγκαίνιά του τελέστηκαν στις 13 Ιουνίου 1982, ημέρα αφιερωμένη στη μνήμη των Αγίων, από τον αείμνηστο Μητροπολίτη Ρεθύμνης και Αυλοποτάμου Τίτο Συλλιγαρδάκη — τον ίδιο ιεράρχη που είχε τελέσει και τα εγκαίνια του καθολικού δέκα χρόνια νωρίτερα, αφήνοντας έτσι το αρχιερατικό του αποτύπωμα σε δύο από τους σημαντικότερους ιερούς χώρους της Μονής.